عباس موسوی سخنگوی وزارت امور خارجه ایران سه‌شنبه ۱۴ خرداد در واکنش به رویدادهای اخیر در سودان گفت: «عمیقاً نگران منازعه قدرت در سودان و تبدیل این کشور به صحنه منازعه محورهای خارجی هستیم». موسوی ضمن تأکید بر «لزوم توجه به مطالبات و خواسته‌های مردم و اهمیت واگذاری سریع امور به غیرنظامیان» و خواهان پرهیز تمامی طرف‌های داخلی درگیر در این بحران «از رویکردهای اتهامی و تعمیق نفرت داخلی و بی اعتمادی گروه‌ها به یکدیگر» شد. سخنگوی وزارت امور خارجه ایران همچنین خواستار «هشیاری مردم سودان در قبال دخالت طرف‌های دارای سابقه در خشونت‌آفرینی، افراط‌گرایی و تربیت و ترویج تروریسم در امور داخلی سودان» شد. ژنرال عبدالفتاح برهان، رئیس شورای انتقالی نظامی سودان سه‌شنبه، یک روز بعد از کشتار معترضان در مقابل وزارت دفاع در خارطوم، معترضان را مسئول کشتار جلوه داد. او در بیانیه‌ای اعلام کرد که شورای نظامیان دولت انتقالی را بدون مشارکت معترضان و جامعه مدنی تشکیل می‌دهد با این هدف که زمینه‌ها و شرایط برگزاری انتخابات آزاد (و بنا به ادعای او) تحت نظارت نهادهای بین‌المللی را فراهم کند.